Про­грам­мист в био­ло­гии

Ал­го­рит­мы Алек­сея Гу­ре­ви­ча по­мо­га­ют ис­кать ан­ти­био­ти­ки

RBC Magazine - - СОДЕРЖАНИЕ - ТЕКСТ Ва­ле­рия По­зы­ча­нюк

Алек­сей Гу­ре­вич — про­грам­мист по об­ра­зо­ва­нию, но в 2017 го­ду во­шел в чис­ло са­мых ци­ти­ру­е­мых рос­сий­ских уче­ных, по вер­сии плат­фор­мы Web of Science, как био­лог.Алек­сей вхо­дит в груп­пу био­ин­фор­ма­ти­ков, ко­то­рые раз­ра­бо­та­ли ал­го­ритм для уско­ре­ния по­ис­ков но­вых ан­ти­био­ти­ков и си­сте­му для оцен­ки ка­че­ства ге­ном­ных сбо­рок.

Био­ин­фор­ма­ти­ка — на­у­ка на сты­ке ма­те­ма­ти­ки, ста­ти­сти­ки и био­ло­гии, в ко­то­рой для ана­ли­за био­ло­ги­че­ских дан­ных при­ме­ня­ют­ся ком­пью­тер­ные ме­то­ды, го­во­рит Гу­ре­вич. В Рос­сии это на­прав­ле­ние не очень рас­про­стра­не­но, но в ми­ре оно раз­ви­ва­ет­ся очень ак­тив­но. Боль­шие фар­ма­цев­ти­че­ские ком­па­нии ин­те­ре­су­ют­ся раз­ны­ми спо­со­ба­ми со­зда­ния но­вых ле­карств и ин­ве­сти­ру­ют в эту сфе­ру. Для Гу­ре­ви­ча, вы­пуск­ни­ка Санкт-Пе­тер­бург­ско­го го­су­дар­ствен­но­го по­ли­тех­ни­че­ско- го уни­вер­си­те­та, зна­ком­ство с био­ин­фор­ма­ти­кой на­ча­лось в 2011 го­ду. Го­дом рань­ше в Рос­сии за­пу­сти­ли гос­про­грам­му «ме­га­гран­тов»: име­ни­тым уче­ным из за­ру­беж­ных уни­вер­си­те­тов пред­ла­га­ли от­кры­вать ла­бо­ра­то­рии в рос­сий­ских ву­зах. Так уда­лось при­влечь де­сят­ки рос­сий­ских уче­ных, в том чис­ле био­ин­фор­ма­ти­ка Павла Пе­взне­ра. Он от­крыл Центр ал­го­рит­ми­че­ской био­тех­но­ло­гии, ку­да и при­шел Гу­ре­вич.

Ста­тьи об ал­го­рит­ме, по­мо­га­ю­щем ис­кать по­тен­ци­аль­ные ан­ти­био­ти­ки, опуб­ли­ко­ва­ли из­вест­ные на­уч­ные жур­на­лы Nature Chemical Biology и Nature Microbiology, что и по­мог­ло мо­ло­до­му уче­но­му, став­ше­му од­ним из ос­нов­ных ав­то­ров ра­бот, по­лу­чить пре­мию за ци­ти­ру­е­мость от Web of Science — по­ис­ко­вой плат­фор­мы, объ­еди­ня­ю­щей ба­зы дан­ных по пуб­ли­ка­ци­ям в на­уч­ных жур­на­лах. «Мно­гие бак­те­рии ста­но­вят­ся устой­чи­вы­ми к су­ще­ству­ю­щим ан­ти­био­ти­кам. Что­бы про­дол­жать лечить бо­лез­ни ан­ти­био­ти­ка­ми, нуж­но ис­кать но­вые ве­ще­ства», — объ­яс­ня­ет Гу­ре­вич.

Для их по­ис­ка ис­сле­до­ва­те­ли со все­го ми­ра от­прав­ля­ют­ся в экс­пе­ди­ции в раз­ные угол­ки пла­не­ты и пы­та­ют­ся отыс­кать но­вые при­род­ные ан­ти­био­ти­ки в еще не до кон­ца ис­сле­до­ван­ных рас­те­ни­ях, гри­бах и мик­ро­ор­га­низ­мах. Но да­же ес­ли уда­ет­ся най­ти ве­ще­ство, ко­то­рое мо­жет стать но­вым ан­ти­био­ти­ком, ухо­дит очень мно­го вре­ме­ни на то, что­бы сопоставить его с от­кры­ты­ми ра­нее хи­ми­че­ски­ми со­еди­не­ни­я­ми, го­во­рит уче­ный. «Наш ал­го­ритм со­здан, что­бы эту про­бле­му ре­шить. Си­сте­ма ав­то­ма­ти­че­ски со­по­став­ля­ет фи­зи­че­ские за­ме­ры най­ден­но­го уче­ны­ми ве­ще­ства с уже из­вест­ны­ми на­у­ке хи­ми­че­ски­ми струк­ту­ра­ми и вы­да­ет ре­зуль­тат: есть ли в этом био­ло­ги­че­ски ак­тив­ном ве­ще­стве что-то но­вое, сто­ит ли тра­тить вре­мя и ресурсы на его ис­сле­до­ва­ние», — по­яс­ня­ет Алек­сей.

Newspapers in Russian

Newspapers from Russia

© PressReader. All rights reserved.