生物分类字典在自然类博物馆藏品信息管理系统中的应用 / 曾朝辉 王俊杰 刘晓丽 夏晓飞 程 晓 李健文
北京自然博物馆 引言藏品是博物馆业务活动的物质基础, 所有社会教育和服务、陈列、研究都离不开藏品。 藏品的数量和质量决定了博物馆的规模和地位。 对自然类博物馆而言, 馆藏标本的种类和数量尤其重要, 必须及时、准确地获取馆藏物种丰富度,掌握馆藏空白物种情况。 目前,自然类博物馆的藏品信息管理系统中,信息录入的工作量相当大, 且不能直接生成馆藏标本名录。因此如何运用数据库技术提高工作效率,是我们迫切需要解决的问题。
数据字典是用于保存数据元素(数据项)和数据特征的说明文件。 通过数据字典可以生成有关数据规模、类型、格式以及含义的报告。它实际上就是“关于系统数据的数据库”。 最初用于数据库管理系统,在系统开发过程以及系统运行后的维护阶段起着重要作用,如确保数据在系统中的完整性和一致性;实现系统内部数据模式、代码与图式图例标准化,进行信息交换、数据共享以及集成化统计、分析等综合处 理工作;相互参照,便于系统修改。
数据字典技术在数据处理方面具有明显优的势。 自 20 世纪 80年代开始,经过多年发展,这项技术取得了很大的进步,广泛应用在多个领域,诸如网络渔业词典、地质灾害数据库等。北京自然博物馆将数据字典技术与生物分类系统结合, 引入到藏品信息管理系统,实现馆藏物种种类、数量和空白物种情况在不同分类阶元层级上的直观展示和统计。生物分类字典的概念生物分类系统是阶元系统,由界、门、纲、目、科、属、种七个分类阶元组成。 根据生物之间相同、相异的程度与亲缘关系的远近,使用不同等级特征,将生物逐级分类。目前,生物分类学上使用较广的是五界分类系统,由美国生物学家魏泰克( Robert Harding Whittaker)于 1969 年提出,把生物界分成了原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界。如表 1所示,以动物分类系统为例,任何一个已知的动物均可无例外地归属于这些阶元之中。
表 1 两种动物在动物分类系统中的精确表示
纲( Class)
哺乳纲( Mammalia)
昆虫纲( Insecta)
生物分类字典的优势 4.1
数据字典的主要目的是实现关系数据库的共享、重用、交互。数据字典在整个数据库管理系统中独立形成一个文件,以指针映射类型将内容对应到不同管理对象的记录中。这样通过数据字典的继承关系和标准化描述,运用分层式树状结构调取数据,减少了同质信息,避免数据库中大量数据的重复存储。4.2
基于最新的研究进展, 生物分类系统要对一些物种的分类阶元进行调整,如拆分或合并物种、提升物种地位、整理物种名称(包括同物异名)等。不同于以往的繁琐流程,现在我们通过修改生物分类字典,即可快速更新相应馆藏物种的分类地位和从属关系。笔者建议每年统一修订一次生物分类字典,以保证内容的科学、准确。出于数据库安全的考量, 必须由专业人员负责数据的批量修改,并及时进行备份,以防止因操作不当造成的数据丢失。生物分类字典的应用前景自然界生物门类众多,数据量庞大,建立哪些门类的分类系统,主要取决于本馆的馆藏情况。北京自然博物馆的收藏以动物、植物、古生物、古人类为主, 因此在《GB/T 15628.1—2009 中国动物分类代码第1 部分:脊椎动物》和《GB/T 14467—93 中国植物分类与代码》的基础上,我们查阅了近些年发表的新物种记录,建立了动物界脊索动物门、节肢动物门昆虫纲和植物界被子植物门、 裸子植物门的生物分类字典,其他门类之后也将视情况陆续录入。
经过三年的实际运行, 北京自然博物馆开发的面向自然类博物馆的生物分类字典功能模块取得了良好的效果。在开发过程中,我们将国家标准分类术语代码引入建模系统,使用标准术语来辅助设计。因此,生物分类字典是一个标准化的数据字典,可以移植到各个不同类型的藏品信息管理系统。同时,若将全国自然类标本登录到同一平台,在标本查询、物种统计等方面能起到统一和规范的作用。 [1]北京博物馆学会.博物馆藏品保管工作指引[M].北京:中国
书籍出版社,2012. [2]吴维宁.网络渔业词典中水生生物分类系统的建立和实现
[J].上海水产大学学报,2003(1):56-60. [3]吴林寰,刘翟,杜晓萌,等.生物信息数据库通用数据字典
标准化研究[J].科技创新导报,2009(26):10,13. [4]赵新颖,汤卓炜.从古生物标本的整理分类及其检索看自
然博物馆的库房管理[J].博物馆研究, 1996(1):82. ( 2018-07-10 收稿, 2018-09-25 修回) 作者简介:曾朝辉( 1977—),男,副研究馆员,研究方向为博物馆藏品保管及动物学, E-mail: 51015216@qq.com。 Application of Bio-classification Data Dictionary in the collection information management system of natural history museums// ZENG Zhaohui, WANG Junjie, LIU Xiaoli, XIA Xiaofei, CHENG1 Xiao, LI Jianwen First-author's Address Beijing$museum$of$natural history,$e-mail:$51015216@qq.com Abstract $ Bio-classification$ Data$ Dictionary$ is$ developed0 on$ the$ base$ of$ bio-classification$ system$ and$ data$ dictionary$ technology$ of$ database.$ Taking$ Beijing$ Museum$ of$ Natural$ History$ as$ an$ example, we analyzed the use of Bio-classification$ Data$ Dictionary$ in$ the$ collection$ information$ management$ system,$and$explore$the$possibility$to$apply$and$promote$it$in$natural$history$museums. Keywords Bio-classification$ Data$ Dictionary,$ natural$ history$ museums,$ collection$ information$ management$system 2018, 4(5) Science Education and Museums
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