♦ Integragen choisit Google Cloud pour son IA

INTEGRAGEN MANIPULE UN VOLUME IMPORTANT DE DONNÉES. L’ENTREPRISE, SPÉCIALISÉE DANS LA TRANSFORMATION DE DONNÉES ISSUES D’ÉCHANTILLONS BIOLOGIQUES EN INFORMATION GÉNOMIQUE ET EN OUTILS DE DIAGNOSTIC POUR L’ONCOLOGIE, FOURNIT DES ANALYSES À DES PRATICIENS. ELLE S’APPUIE POUR CELA SUR LES OUTILS DE GOOGLE.

Dans sa recherche, Integragen séquence le génome humain. À partir de là, dans le cas du cancer, les mutations génétiques responsables de la pathologie pour apporter au patient le bon traitement de médecine personnalisée. Selon les caractéristiques moléculaires de la pathologie identifiée par les anomalies constatées, le patient peut suivre un traitement dans le cadre d’une médecine « de précision » . Le marché de la médecine de précision est estimé à 141 milliards de dollars. Bérangère Génin, responsable de la bio- informatique chez Integragen explique : « Nous voulons démystifier L’IA auprès des médecins. Nos outils sont à destination d’experts, et en aucun cas des outils de substitution de leur expertise. Nous voulons les aider dans leur interprétation du diagnostic ou sur la tumeur du patient pour engranger aussi de la donnée regroupée dans un data lake et assister les cliniciens pour traiter leurs données. » Les outils sont bâtis sur des modèles propres à Integragen. L’entreprise s’est trouvée cependant bloquée par la puissance de calcul nécessaire. Elle était incapable de satisfaire la demande de réponses pour les patients.

Un choix raisonné

Avant de faire son choix, la start- up a procédé à un tour du marché et a vu les principaux acteurs du secteur du Cloud public ou offrant des offres d’intelligence artificielle de haut niveau. Certaines étaient trop cloisonnées selon Bérangère Génin, d’autres faisaient beaucoup de promesses mais étaient incapables de les tenir. La réactivité de certains acteurs interrogés était aussi sujette à caution.

Le choix s’est porté sur la plateforme et les outils de Google Cloud Platform du fait de leur engagement avec Integragen. « Ils nous ont permis de monter rapidement en compétence durant l’été 2017. Nous avions un produit viable en janvier de cette année pour annoncer que nos produits Sirius et Mercury étaient disponibles sur la plateforme. Le fait que Google ait annoncé que la plate- forme soit conforme au RGPD a été aussi un élément important » , ajoute Bérangère Génin. La solution qui a été conjointement développée utilise une suite complète de Google Cloud Platform incluant les outils suivants :

• Google Kubernetes Engine est une infrastructure flexible de haute performance assurant une connexion aux applications extérieures avec une haute disponibilité et une infrastructure élastique, autorisant l’exécution de tâches en parallèle et réduisant de manière drastique le temps de cycle de chacune d’entre elles.

• Google Compute Engine VM et Google Cloud Storage fournissent les clusters à haute performance, améliorés par l’utilisation de SSD locaux attachés aux noeuds de calcul, permettant une amélioration significative des performances des tâches nécessitant l’utilisation de fichiers temporaires ultra- volumineux.

• Google Bigquery est un entrepôt de données cloud rapide, hautement adaptable et entièrement géré, destiné à l’analyse de données. Integragen paie à l’utilisation par analyse et dépense donc juste ce qui est nécessaire. Autre avantage, l’entreprise n’a pas à gérer la plate- forme, ce qui aurait été trop lourd pour son équipe de treize personnes du service informatique. ❍

« Nos outils sont à destination d’experts, et ne sont en aucun cas des outils de substitution de leur expertise »

Bérangère Génin responsable de la bio- informatique Integragen