Juan Antonio Bardem, además de hijo de actores, era sobrino de Mercedes y Guadalupe Muñoz Sampedro, primo de Luchy Soto –casada con Luis Peña–, hermano de Pilar y tío de Javier y Carlos. Dos de sus hijos han ganado el Goya: Miguel, director, por el corto ‘La madre’ (1996), y Juan, compositor.
Los actores Matilde Muñoz Sampedro y Rafael Bardem, sus padres.
Con María Aguado, su mujer, madre de sus cuatro hijos: Miguel, Juan, Rafael y María.
Su hijo Juan, compositor, ganó el Goya por ‘Al sur de Granada’ (2003). Se lo entregó su tía Pilar.
Con el Goya de Honor, en 2002, junto a su hermana, Pilar, y su hijo Miguel, director, como él.