ISP dice que variante británica no se ha detectado en Chile
Organismo aclara que no significa que no esté, aunque como se ha detectado en pocos países, la probabilidad es baja. Según señala la entidad, al menos cuatro variantes genéticas del coronavirus circulan en territorio nacional.
La imagen del nuevo coronavirus Sars-CoV-2 ya es por todos conocida, una figura redonda con muchas puntas que asemejan a una corona (de ahí su nombre) y sobre ella, la proteína Spike (S) o Espiga que es la que se adhiere a las células humanas para infectarlas.
En su interior está el material genético del virus, su ARN, que es donde ocurren las mutaciones de los virus, que aunque naturales para estos microorganismos, hoy tienen a todo el mundo preocupado por estos cambios, como el ocurrido en el Reino Unido y Sudáfrica.
Estas mutaciones o “errores en el momento de la replicación” o reproducción del virus, podrían significar en algún momento, un cambio de comportamiento del virus, algo que por el momento no ha ocurrido.
Cada vez que el virus sufre un cambio en la composición de su ARN, se habla de una mutación y para saber si un virus ha mutado o no, es que se realizan análisis filogenético o secuenciación genómica.
En Chile, de acuerdo a estos análisis realizados por el Instituto de Salud Pública (ISP), existen al menos cuatro variantes del virus SarsCoV-2 circulando en el país, ninguna de ellas corresponde a la variante detectada en el Reino Unido (B.1.1.7).
Jorge Fernández, jefe del Subdepartamento de Genética Molecular del ISP, explica que luego de secuenciar el genoma del coronavirus, esa información se compara con la del genoma del primer coronavirus secuenciado en enero en China (Wuhan, original sin mutaciones) cuando
se iniciaba en la pandemia y con los virus que se sabe están circulando en el país y en el mundo. “Ahí vemos cambios en clados o variante (análisis macro de las secuencias)”, explica.
Para ordenar el conocimiento, los científicos agrupan al Sars-CoV-2 en grupos macro y hablan de clados o ramas (como estructura de árbol) de un virus, las que se identifican con letras. En el caso de este coronavirus se han identificado las letras S (que tenía el virus originalmente en China), y luego, con las mutaciones propias de los coronavirus, han ido apareciendo loscl ad os V, O, G, GH, GR yGV.
Como subdivisión de cada clado o letra, hay linajes o variantes que se representan por letras y números, según la mutación que presenten.
“En Chile, la variante o clado que más se ha encontrado es la GR, con linajes B.1.1.3.5, B.1.1.1., B.1.1.3.3., B.1.1. y entre ellos, el que más predomina es el B.1.1.3.3.”, indica el jefe del Subdepto. de Genética Molecular del ISP.
La variante S, que era la que salió de Wuhan, hoy casi está desapareciendo.
El virus que circula en el país es muy similar al que está circulando en el resto de Latinoamérica, advierte Fernández. “La nueva variante detectada en el Reino Unido circula desde septiembre. En Chile no se ha detectado aún, pero eso no significa que no esté. Se ha encontrado en pocos países, por lo que es baja la probabilidad de que esté acá, no es una variante que esté masificada”, dice Fernández.
Secuenciaciones
Casi todas las secuenciaciones de coronavirus que se realizan en el mundo se suben a la plataforma Gisaid (sitio que recopila más de 280 mil secuenciaciones de
genoma de Sars-CoV-2). Chile a la fecha ha cooperado con 510 secuenciaciones realizadas por el ISP y otras 107 hechas por otros laboratorios.
“En Chile, no sabemos si esas son todas las secuenciaciones que se han hecho o si hay más y no se han compartido en la plataforma. Como centro de referencia, estamos en contacto con la Organización Mundial de Salud (OMS) y la Organización Panamericana de la Salud (OPS), para tener una vigilancia más activa y en tiempo real del virus que circula. Es el cambio que se tiene que hacer, pasar de la etapa del diagnóstico a la de análisis del genoma”, dice Fernández.
A nivel Latinoamericano, Chile es uno de los tres países que más secuenciaciones realiza. En primer lugar se ubica Brasil, segundo Colombia, tercero Chile y en cuarto lugar, Perú. ●