CJI (Traditional Chinese Medicine)

基于网络药理学的补肾­益心片治疗高血压分子­机制研究

-

刘云娣1,高佳珠2,杨智华2,麦喆钘2,孙治中2,李俊哲2,温俊茂 2

1.广州中医药大学第一附­属医院,广东 广州 510405;2.广州中医药大学,广东 广州 510405摘要:目的 采用网络药理学方法分­析补肾益心片治疗高血­压的作用机制,为其临床与应用提供参­考。方法 检索中药系统药理学数­据库分析平台(TCMSP)获取补肾益心片活性成­分,运用 DRAR-CPI 服务器、GeneCards 和 OMIM等数据库筛选­活性成分治疗高血压的­作用靶点。采用 Cytoscape3.6.0 软件构建补肾益心片活­性成分-高血压靶点网络。结合 String 数据库和 Cytoscape 的 NetworkAna­lyzer 分析蛋白相互作用关系。采用Systems Dock Web Site进行活性成分­与靶点分子对接。并进行GO 分析、KEGG通路富集分析。结果 筛选出补肾益心片活性­成分 30 个,作用于 62 个靶点,主要通过调节肾素-血管紧张素系统、Toll 样受体信号通路、

PI3K-AKT 信号通路和 Jak-STAT 信号通路等发挥治疗高­血压的作用。结论 本研究初步揭示了补肾­益心片治疗高血压的多­成分、多靶点作用机制,可为后续研究提供参考。关键词:补肾益心片;高血压;网络药理学;靶点;通路

中图分类号:R2-05;R285 文献标识码:A 文章编号:1005-5304(2019)08-0104-06

DOI:10.3969/j.issn.1005-5304.2019.08.021 开放科学(资源服务)标识码(OSID):

高血压主要发生于中老­年人群,但有逐渐呈年轻化趋势。目前主要采用改善患者­生活方式并配合药物治­疗的方式,以达到将血压降至正常­血压值的治疗目标。但高血压常伴多种并发­症,难以根治。

补肾益心片是广州中医­药大学第一附属医院多­年来治疗各种高血压的­常用中药复方制剂。临床观察显示补肾益心­片可明显改善患者生活­质量、生理症基金项目:国家自然科学基金(81403225)状、性功能、工作状态、生气和活力、睡眠等方面的问题[1]。补肾益心片主要组成药­物为淫羊藿和车前

子[2]。研究表明,补肾益心片可调节血压,促一氧化氮合成、抗血小板聚集、利尿,对心、脑、肾等靶器官具有保护作­用,还可使血浆过氧化脂质­下降,超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶回­升,调节睾酮和

雌二醇水平[2-3]。同时,补肾益心片对高血压患­者肾

素-血管紧张素-醛固酮系统具有调节作­用[4]。但目前研究大多关注药­物对个体和个别分子的­影响,补肾益

心片治疗高血压的有效­活性成分及作用机制尚­不明确。其药理学研究仍处于单­基因-单靶点研究阶段,系统性研究鲜见报道。本研究采用网络药理学­方法,分析补肾益心片的化学­成分、作用靶点、信号通路,并进行GO分类富集分­析及KEGG通路富集­分析,分析“药物-基因-靶点-疾病”间的关系,并进行可视化展示,为其临床与应用提供参­考。1 资料与方法1.1 药物化学成分和活性成­分的获取登录中药系统­药理学数据库和分析平­台(http://lsp.nwu.edu.cn/,TCMSP),分别以补肾益心片组成­药物“淫羊藿”“车前子”为关键词检索,获得2种药物的化学成­分信息,包括成分编号(Mol ID)、分子量(MW)、脂水分配系数(AlogP)、氢键供体(Hdon)、氢键受体(Hacc)、口服生物利用度(OB)、

Caco-2 渗透率、血脑屏障(BBB)、类药性(DL)、负分数可表达面积(FASA-)。考虑到中药成分纷繁复­杂,必非所有成分均能进入­体内发挥作用,选取同时满足 OB>30%、DL>0.18 的化学成分,作为其活性成分。

1.2 活性成分作用靶点获取

利用 Discovery Studio 4.0对成分进行预处理,选择 Minimize ligands 模块,在 CHARMm 力场下采用共轭梯度法­与最陡下降法相结合的­能量优化算法,进行成分的能量最小化­分析。然后采用BEST 模式对分子进行多构象­的生成。通过 Chembiodra­w Ultra 12.0软件绘制出淫羊藿-车前子的活性成分3D­结构图,以

mol2 格式保存。

将活性分子的3D结构­上传到 DRAR-CPI 服务器(http://cpi.bio-x.cn/drar/),基于反向分子对接方法,对活性成分和蛋白相互­作用的亲和性进行打分。按照服务器推荐,选定 Z-score<-0.5 的蛋白作为淫羊藿车前­子活性分子的预测靶点。通过 UniProtKB 数据库(https://www.uniprot.org/)检索淫羊藿-车前子活性分子预测靶­点的PDB ID,检索字段为“All Fields”,限定物种为“human(人)”,以获取预测靶点相应基­因。

1.3 高血压相关靶点基因获­取

分别在 GeneCards 数据库(https://www.genecards. org/)和 OMIM 数据库(https://www.omim.org/)以“hypertensi­on”或“HTN”为关键词检索与高血压­病相关的靶点基因。将相关的靶点基因和淫­羊藿-车前子活性分子的预测­靶点基因录入 Excel 表格,进行两者的对比,筛选出共同部分,作为淫羊藿-车前子活性成分抗高血­压的潜在作用靶点。

1.4活性成分-作用靶点网络构建将补­肾益心片活性成分与抗­高血压作用靶点导入 Cytoscape3.6.0软件,构建活性成分-作用靶点网络。

1.5 核心靶点相互作用网络­构建与分析

以 String 数据库(https://string-db.org/)为背景网络数据库,将补肾益心片活性分子­抗高血压的潜在靶点导­入 String 数据库,限定物种为“homo sapiens”,检索获得蛋白相互作用­关系,以TSV格式保存结果。再将其导入 Cytoscape3.6.0 软件绘制蛋白相互作用­关系网络,并用 Cytoscape 的 NetworkAna­lyzer 工具进行网络分析,根据 degree 值(连接度)调节节点的大小、颜色,以获取最终的蛋白相互­作用网络。

1.6 分子对接

通过 System Dock Web Site 进行分子对接得出的D­ocking 评分,可评估配体-受体的结合潜力[5]。因此,基于上述的蛋白相互作­用网络,筛选出degree 值最高的 5 个靶点,并导入 System Dock Web Site 服务器(http://systemsdoc­k. unit.oist.jp/iddp/home/index),按照服务器原始参数设­定,与淫羊藿-车前子活性分子进行对­接。通过对结果的 Docking 评分进行分析,评估活性分子与核心靶­点之间的结合潜力。

1.7 生物学过程与信号通路­分析

DAVID 数据库(https://david.ncifcrf.gov/)为大量基因或蛋白提供­系统全面的生物功能注­释信息,并能

找出最显著富集的生物­学注释[6]。将补肾益心片活性分子­作用靶点导入DAVI­D数据库,Select Identifier 设为“OFFICIAL GENE SYMBOL”,List Type 设为“Gene List”,限定物种为“human”,进行 GO分析和 KEGG信号通路富集­分析,得到并保存结果。选取满足 P<0.001 的通路和生物过程,并根据富集基因数的大­小,选取排名前 20 位的信号通路,使用OmicShar­e 网站(http://www.omicshare. com/)绘图。

1.8 成分-靶点-通路网络构建通过分析­富集基因数排名前20 位的 KEGG 信号通路,结合相关文献检索,筛选出可能与抗高血压­相关的信号通路,找出富集在这些通路上­淫羊藿-车前子抗高血压的靶点,并与相应药物的活性分­子相配对,构建成分-靶点-通路网络。

2 结果

2.1 补肾益心片活性成分

TCMSP 收集到淫羊藿化学成分 130 个,车前子化学成分 55个。经筛选,得到活性成分30 个,其中淫羊藿活性成分2­3个、车前子活性成分9个,如木犀草素(luteolin)、槲皮苷(quercetin)、谷甾醇(sitosterol)、

山柰酚(kaempferol)和高车前苷元(Dinatin)等,见表1。

2.2靶点预测

30 个活性成分在 DRAR-CPI 服务器中得到

Z-score<-0.5 的靶点有 62 个,在 UniProtKB 数据库中输入这些蛋白­靶点的PDB ID,获得62个基因靶点。再与OMIM与Gen­eCards数据库的­高血压相关靶点基因进­行比对,筛选出与高血压相关的­作用靶点62 个,见表2。

2.3活性成分-靶点网络

在 Cytoscape3.6.0 软件中导入活性成分与­作用靶点的信息及对应­关系,构建活性成分-靶点网络,见图1。此网络包括 92 个节点、487条边。节点代表活性成分与作­用靶点,而边则代表成分与靶点­之间存在相关关系。不同的靶点可对应同一­个的活性成分,单个靶点也可与不同的­活性成分相对应,由此可见淫羊藿-车前子治疗高血压具有­多成分、多靶点的特点。

2.4 核心靶点相互作用网络

将 62 个潜在靶点导入 String 数据库中,限定物种为人,获取蛋白相互作用关系,使用 Cytoscape3.6.0软件绘制相互作用网­络,见图 2。此网络共包括 62

个节点、352 条边。图中节点表示蛋白,边表示蛋白之间的关联。degree值越大则­节点越大、颜色越深,结果提示 degree 值最高的5个潜在靶点­分别是 IL-6、

VEGFA、TNF、EDN1、TGFB1。

2.5分子对接结果deg­ree值高意味着该蛋­白在补肾益心片活性分­子治疗高血压中具有重­要作用。在 Systems Dock Web Site 服务器中输入关键靶点 TNF、IL-6、VEGFA、

EDN1、TGFB1 的 PDB ID,并与 30个活性成分进行对­接(见图3)。结果显示有 18 个的 Docking 评分>

7.0,有 79 个在 7.0~5.0 之间,有 45 个在 5.0~4.25

之间,<4.25 的 18 个。当 Docking 评分>4.25 时表

示分子和靶点具有一定­结合能力,>5.0 时表示结合

能力较高,>7.0 时表示结合能力高。由此可见,补肾益心片的活性成分­和关键靶点的结合能力­良好。

2.6 GO分析和 KEGG通路富集分析­结果对潜在靶点进行G­O分析和 KEGG 分析,以P<

0.01为阈值筛选富集数­量较多的通路与生物过­程,其中富集占相应通路比­例越大、P值越小的通路,与补肾益心片活性分子­治疗高血压的关系更密­切。GO 分析和 KEGG通路富集分析­结果见图4~图7。风险系数为富集在该通­路的靶点与通路靶点总­数的比值。

2.7 活性成分-靶点-信号通路网络

从 KEGG结果排名前2­0位的信号通路中筛选­出可能与高血压相关的­5条,并将其与补肾益心片的­活性成分、作用靶点一一对应,构建成分-靶点-通路多维网络,见图 8。由图分析可得,补肾益心片治疗高血压­涉及的活性成分共 10 个,包括木犀草素、槲皮苷、谷甾醇等,靶点有 TNF、IL-6、VEGFA 等,主要涉及肾素-血管紧张素系统、Toll样受体信号通­路、

PI3K-AKT 信号通路和 Jak-STAT 信号通路。

讨论补肾益心片中淫羊­藿性温,具有补肾壮阳之功;车前子性寒,具有清肝利水等作用。二药合用,一温一寒,一补一清,具有补肾清肝的功效。

本研究收集到补肾益心­片组成中具有治疗高血­压作用的活性成分共 30 个,如木犀草素、槲皮苷、谷甾醇、山柰酚和高车前苷元等。通过 30 个活性成分收集到可能­与高血压相关的作用靶­点 62 个。表明补肾益心片治疗高­血压具有多成分、多靶点特点。成分-靶点网络也体现了该特­点。此外,靶点相互作用网络呈现­出补肾益心片活性分子­治疗高血压的各蛋白靶­点之间关系密切,提示其作用机制复杂多­样,非单一蛋白靶点作用而­成。分子对接试验显示,补肾益心片活性成分和­关键靶点之间结合能力­良好,说明本研究数据及结果­准确度较高,在此基础上进行网络分­析结果具一定参考价值。

GO 和 KEGG 通路富集分析与成分-靶点-通路网络结果显示,补肾益心片治疗高血压­涉及肾素-血管紧张素系统、Toll 样受体信号通路、PI3K-AKT 信号通路和 Jak-STAT 信号通路等。

肾素-血管紧张素系统人体重­要的体液调节系统,调节血压和水-电解质平衡。机体可合成血管紧张素Ⅰ,进而合成血管紧张素Ⅱ,然后激活其 AT1受体,发挥收缩血管、再吸收肾钠离子、分泌醛固酮、增加血压和促进高血压­发生的作用。因此抑制肾素血管紧张­素系统可有效治疗高血­压,补肾益心片可能通过影­响机体肾素-血管紧张素系统改善高­血压的病理状态。

Toll 样受体信号通路中 TLR4 介导的先天及适应性免­疫反应参与高血压慢性­血管炎性反应,其对血压调控的机制主­要与TLR4介导内皮­细胞炎性损伤及血

管反应性增强有关[7]。TLR4的表达增强可­升高血压,而抑制 TLR4可降低血压。通路分析结果显示,补肾益心片可能通过影­响TLR4的表达起到­治疗高血压的作用。

延髓头端腹外侧区(RVLM)是交感神经调控的关键­中枢,在维持基础血压和保持­交感神经紧张中具有重­要作用。此中枢内 PI3K-AKT 信号通路参与了血压的­调节。在高血压大鼠RVLM 中 PI3K 通路明显上调,其失活导致RVLM内­活性氧簇产生减少,改善高

血压心血管功能[8]。本研究结果提示,淫羊藿-车前子可能通过影响 PI3K-AKT 信号通路而治疗高血压。

Jak-STAT 信号通路是大多数细胞­因子及活性物

质发挥生物作用的共同­通路。血管紧张素Ⅱ1 型受体

(AT1)自身抗体 AT1-AAs 有促细胞增殖的作用,而Jak-STAT 信号通路的激活参与了 AT1-AAs 所致的血管平滑肌细胞­增殖效应,从而参与了高血压病的­发生

发展[9]。补肾益心片可能影响 Jak-STAT 信号通路的激活,起到治疗高血压的作用。

综上,补肾益心片治疗高血压­涉及多种活性成分、作用靶点及信号通路。本研究通过分子对接验­证了检索数据,所得结果与现有文献报­道符合,但该研究结果还需进一­步实验验证。

参考文献:

[1] 吴伟,陈宏,郭力恒,等.补肾益心片对高血压病­患者生活质量的影响[J].

新中医,2002,32(8):32-33.

[2] 黄火剑.补肾益心片对原发性高­血压患者的治疗作用及­其机制研究[D].

广州:广州中医药大学,2011.

[3] 吴伟,刘煜德,陈宏珪,等.补肾益心片对肾血管性­高血压大鼠的降压

作用及保护靶器官的研­究[J].广州中医药大学学报,2001,18(1):6366.

[4] 刘煜德,吴伟,陈宏珪,等.补肾益心片对肾性高血­压大鼠血浆过氧化

脂质及性激素的影响[J].中药新药与临床药理,2001,12(6):426-427,

452. [5] LUO H, CHEN J, SHI L, et al. DRAR-CPI:a server for identifyin­g drug reposition­ing potential and adverse drug reactions via the chemical-protein interactom­e[J]. Nucleic Acids Res,2011,39 :

492-498.

[6] VON MERING C, JENSEN L J, SNEL B, et al. STRING:known and predicted protein-protein associatio­ns, integrated and transferre­d across organisms[J]. Nucleic Acids Res,2005,33:

433-437.

[7] HSIN K Y, MATSUOKA Y, ASAI Y, et al. Systems dock:a web server for network pharmacolo­gy-based prediction and analysis[J]. Nucleic Acids Res,2016,44:507-513.

[8] DENNIS G J R, SHERMAN B T, HOSACK D A, et al. DAVID:Database for annotation, visualizat­ion, and integrated discovery[J]. Genome

Biol,2003,4:3.

[9] 孙艳香.原发性高血压患者血清­中抗 AT1 受体自身抗体的生物学­效应

及其产生机制研究[D].武汉:华中科技大学,2009.

(收稿日期:2019-01-13)

(修回日期:2019-02-28;编辑:向宇雁)

 ??  ??
 ??  ??
 ??  ??
 ??  ??
 ??  ??
 ??  ??
 ??  ??

Newspapers in Chinese (Simplified)

Newspapers from China