CJLIS (Traditional Chinese Medicine)
基于网络药理学探讨沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制
吴文韬1,李俊熙1,尹晓清 2*
1.湖南中医药大学,湖南 长沙 410208;2.湖南中医药大学第一附属医院,湖南 长沙 410007
摘要:目的 从药物、疾病、靶点角度研究沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制,为进一步实验验证提供理论基础。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台( TCMSP )及中医药综合数据库
(TCMID)收集沙参麦冬汤药物有效成分,导入 PubChem 数据库获取有效成分结构,将结构导入Swiss TargetPrediction 数据库进行靶点预测;通过 GeneCards 数据库收集肺癌靶点,将有效成分靶点与肺癌靶点取交集,并绘制中药-有效成分-疾病网络;通过 String 数据库及 Cytoscape 3.8.0 软件构建蛋白相互作用网络;通过 DAVID 数据库对交集靶点进行 GO 功能富集与 KEGG 通路富集。结果 收集并筛选沙参麦冬汤有效成分 56 个,靶点 852 个,肺癌疾病靶点 614 个,二者交集靶点 145 个,主要靶点有SRC、PIK3CA、MAPK1、MAPK3、PIK3R1 等。GO 功能富集得到生物过程条目 604 个、细胞成分条目 78 个、分子功能条目 124 个;KEGG 通路富集共计 143 条信号通路,主要涉及癌症通路、癌症中蛋
白多糖、PI3K-Akt 信号通路、癌症中心碳代谢等。结论 本研究揭示了沙参麦冬汤在肺癌治疗中多成分、多靶点、多途径的作用特点,为后续研究提供了理论依据。关键词:沙参麦冬汤;网络药理学;肺癌;信号通路;靶点
中图分类号:R285;R259 文献标识码:A 文章编号:2095-5707(2021)02-0006-05
DOI: 10.3969/j.issn.2095-5707.2021.02.002 开放科学(资源服务)标识码(OSID): Mechanism of Shashen Maidong Decoction in Treatment of Lung Cancer Based on Network Pharmacology
WU Wen-tao1, LI Jun-xi1, YIN Xiao-qing2*
(1. Hu’nan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China; 2. The First Hospital of Hu’nan University of Chinese Medicine, Changsha 410007,China)
Abstract: Objective To study the mechanism of Shashen Maidong Decoction in treatment of lung cancer from the perspective of drug, disease, and target; To provide theoretical basis for further experimental verification. Methods The main active components of Shashen Maidong Decoction were collected and screened by TCMSP and TCMID, which were imported into the PubChem database to obtain the active component structure, and the structure was imported into the Swiss TargetPrediction database for target prediction; the target of lung cancer was predicted by GeneCards database, the common targets were screened and integrated, and TCM-active components-disease network was pictured. A common target PPI network was constructed using String database and Cytoscape 3.8.0 software; GO and KEGG enrichment analysis were performed on the common target using DAVID database combined with Cytoscape software. Results Totally 56 active components, 852 targets, 614 lung cancer disease targets, and 145 common targets of Shashen Maidong
基金项目:湖南省中医药科研计划项目(201788)第一作者:吴文韬,E-mail: 179572724@qq.com *通讯作者:尹晓清,E-mail: 18234142767@163.com
Decoction were collected and screened. The main targets were SRC, PIK3CA, MAPK1, MAPK3, PIK3R1, etc., GO enrichment analysis including 604 biological process, 78 cellular components and 124 molecular function; KEGG pathway enrichment including 143 signaling pathways, mainly involved in cancer pathway, proteoglycan in cancer, PI3K-Akt signaling pathway, cancer center carbon metabolism, etc. Conclusion This study shows that Shashen Maidong Decoction has the characteristics of multi-component, multi-target and multi-pathway in treatment of lung cancer, which can provide a theoretical basis for follow-up research.
Key words: Shashen Maidong Decoction; network pharmacology; lung cancer; signal pathway; target
原发性支气管肺癌简称肺癌,是我国及世界范
围内发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一[1]。肺癌
属中医“肺积”“咳嗽”“咳血”“胸痛”范畴,多由正气内虚、感受邪毒、情志抑郁、饮食损伤、宿有旧疾等所致,使脏腑功能失调,气血津液运行失常而产生气滞、血瘀、痰凝、湿浊、热毒等病理变化。《素问•玉机真脏论篇》曰:“大骨枯槁,大肉陷下,胸中气满,喘息不便,内痛引肩项,身热脱肉破䐃,真脏见,十月之内死。”肺癌病位主要在肺,同时传变肝、脾、肾,总属本虚标实,以五脏亏虚为本,痰、热、瘀为标,随着疾病进展常伴有干咳、少痰、胃部隐痛、五心烦热等症,属肺胃阴虚证。
已有研究表明,沙参麦冬汤对临床出现肺胃阴虚
证的早期肺癌术后及中晚期化疗患者疗效显著[2-4]。
沙参麦冬汤出自《温病条辨•卷一》,由南沙参、北沙参、麦冬、桑叶、白扁豆、天花粉、玉竹组成,以南沙参、北沙参、麦冬清养肺胃,玉竹、天花粉
生津解渴,白扁豆益气培中,辅以桑叶清宣燥热,7
味药合而成方,治以清养肺胃、生津润燥,在长期
临床应用中取得较好疗效[5-6]。本研究通过网络药理
学分析沙参麦冬汤药物成分,预测其治疗肺癌的潜在靶点,进而揭示沙参麦冬汤治疗肺癌作用机制。
1 材料与方法
1.1 沙参麦冬汤有效成分收集与筛选
通过中药系统药理学数据库与分析平台( TCMSP , http://tcmspw.com/tcmsp.php )及中医药综合数据库( TCMID , http://119.3.41.228:8000/ tcmid/)整合沙参麦冬汤中南沙参、北沙参、麦冬、桑叶、白扁豆、天花粉、玉竹 7 味中药的有效成分,根据人体药物的吸收、分布、代谢、排泄、毒
性参数,以口服生物利用度(OB)≥30%且类药性(DL)≥0.18 为限定条件筛选沙参麦冬汤中主要有效成分。
1.2 中药有效成分靶点预测与共同靶点筛选
通过 PubChem 数据库( https://pubchem.ncbi.
nlm.nih.gov)获取中药有效成分结构,将其 3D 结构保存为 SDF 格式。将有效成分结构导入 Swiss TargetPrediction 数据库( http://www.swisstarget prediction.ch)中进行靶点预测,剔除未能预测的有
效成分,获取中药有效成分靶点。
通过 GeneCards 数据库(https://www.genecards. org)检索“肺癌”(Lung Cancer)靶点,以 Score≥ 30 为条件获取疾病靶点。将中药有效成分预测靶点与肺癌疾病靶点取交集,获得成分-疾病共同靶点,使用 Cytoscape3.8.0 绘制中药-有效成分-疾病网络。
1.3 蛋白相互作用网络构建
将共同靶点导入 String 数据库( http://www. string-db.org),设定最低要求互动分数为最高置信
度 0.90,得到蛋白相互作用(PPI)网络。
将 PPI 网络导入 Cytoscape3.8.0 使结果可视化,并使用 Network Analyzer 功能计算 Degree 值,根据
Degree 值对靶点进行筛选分析。
1.4 GO功能富集与 KEGG 通路富集
将共同靶点导入 DAVID 数据库(https://david. ncifcrf.gov ),将 Select Identifier 选择为 Official gene symbol,Gene list 与 Background 选择 Homo sapiens ,依次导出生物过程( BP )、细胞成分
(CC)、分子功能(MF),并进行 KEGG 通路富集分析,选择 P 值升序前 10 数据,取-LgP,-LgP 值越大表明富集程度越高。
2 结果
2.1 沙参麦冬汤有效成分筛选
通过 TCMSP 及 TCMID 数据库收集中药有效成分 480 个,包括南沙参 82 个、北沙参 35 个、玉竹62 个、桑叶 269 个、白扁豆 14 个、天花粉 15 个、麦冬 3 个,经过筛选后得到主要有效成分 56 个:南沙参 5 个、北沙参 8 个、玉竹 8 个、桑叶 29 个、白扁豆 1个、天花粉2个、麦冬3 个。
2.2 靶点预测与共同靶点筛选
将 56 个中药有效成分导入 PubChem 数据库,
剔除无法获得结构或结构种类不明确的有效成分,得到有效成分 42 个,导入 Swiss TargetPrediction 数据库进行靶点预测,共得到预测靶点 4511 个,去除重复靶点后,得到中药有效成分靶点 852 个。通过GeneCards 数据库获取肺癌疾病靶点 614 个。将中药有效成分靶点与肺癌靶点取交集,得交集靶点145个,中药-有效成分-靶点网络见图1。2.3 蛋白相互作用网络
PPI 网络(图 2)中包括 137 个节点,805 条边(其中 ADA、MTAP、TLR9、HPGD、CTSB、ACE、FASN、SETD2 无相互作用),根据 Degree 值大小设定节点大小,一般认为节点越大,Degree 值越大,节点连接的边数越多,该相互作用蛋白在PPI 网络中越重要,Degree 值≥20的靶点见表1。
2.4 GO功能富集与 KEGG 通路富集结果
BP 富集结果共计 604 个,主要富集于凋亡过程负调控、蛋白质自我磷酸化、肽基酪氨酸磷酸化、细胞增殖正调控、磷脂酰肌醇介导信号转导、蛋白质磷酸化、药物反应、蛋白质磷酸化正调控、ERK1和 ERK2 级联正调控、细胞迁移正调控。根据“Term”与“-LgP”绘制对应条图,见图3。
CC 富集结果共计 78 个,主要富集于细胞浆、细胞核、核质、细胞质、细胞表面、线粒体、质膜、受体复合体、黏着斑、膜筏。根据“Term”与“-LgP”绘制对应条图,见图4。
MF 富集结果共计 124 个,主要富集于 ATP 结合、蛋白质结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、激酶活性、酶结合、蛋白激酶活性、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸 3-激酶活性、同一
蛋白结合、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性。根据“Term”与“-LgP”绘制对应条图,见图5。
KEGG 通路富集共计 143 条信号通路,主要富
集于癌症通路、前列腺癌、癌症中蛋白多糖、PI3KAkt信号通路、癌症中心碳代谢、胰腺癌、乙型肝
炎、慢性粒细胞白血病、膀胱癌、Ras 信号通路。
根据“Term”与“-LgP”绘制对应条图,见图 6。3 讨论
网络药理学整合基因、蛋白质、DNA 等生物分子,揭示了中药靶点与疾病之间的关系,并构建
PPI 网络,分析细胞生物过程、细胞成分、分子功
能等[7],深刻体现了由整体到局部再到整体的中医整体观念,中医学在分析疾病的病理状况时,先从整体出发,将重点放在局部病变引起的整体病理变化上,将局部变化与整体病理反应统一,与网络药理学探究方向极为相似。本文基于网络药理学方法,结合中医整体观念,选取沙参麦冬汤,探究其在肺癌治疗中的作用机制,为临床治疗提供依据。
本文对沙参麦冬汤中君药南沙参、北沙参、麦冬,臣药玉竹、天花粉,佐药桑叶、白扁豆的有效药物成分进行收集与筛选,得到有效成分 480 个,其中部分有效成分对肺癌治疗的作用机制明确,如玉竹多糖在以人肺癌细胞 A549 为模型的情况下,
[8]能有效抑制体外肺癌细胞的增殖 。同时基于GeneCards 数据库,得到肺癌靶点 614 个,筛选出肺癌与沙参麦冬汤交集靶点 145 个,将交集靶点构建 PPI 网络。本研究筛选出的共有靶点与已有研究
中肺癌肺胃阴虚证靶点蛋白具有高度相似性[9-10]。
GO 富集分析结果表明,沙参麦冬汤涉及多方
面分子功能,如对酪氨酸激酶活性的影响。已有研究表明,阿帕替尼通过选择性抑制血管生长因子受体酪氨酸激酶活性达到抑制肿瘤生长的目的[11]。吕冰洁等[12]研究表明,非小细胞肺癌的癌细胞侵袭和
转移表型涉及 ERK1/2 信号通路。杨熹等[13]认为,
通过抑制磷脂酰肌醇介导的信号转导可抑制非小细胞肺癌的癌细胞侵袭和迁移。崔丽等[14]研究表明,
部分化疗药物作用机制可能与线粒体途径诱导的细胞凋亡相关。
KEGG 通路富集分析结果表明,沙参麦冬汤涉及癌症通路、癌症中蛋白多糖、PI3K-Akt 信号通路、癌症中心碳代谢等。王晓燕等[15]认为,可以在
葡萄糖转运和能量代谢途径中阻断失调的癌基因或恢复功能丧失的肿瘤抑制基因,以探索治疗肺癌的方法。Gupta 等[16]表明,蛋白多糖具有靶向增强细
胞抗肿瘤的功能,但目前对其功能机制的认识尚不明确。PI3K-Akt 信号通路具有调节细胞周期、蛋白质合成的作用,在癌症发病中 PI3K-Akt 信号通路通过多方面抑制细胞凋亡,促进细胞增殖、肿瘤转移及新生血管生成[17]。
综上,基于网络药理学分析沙参麦冬汤治疗肺癌的有效成分及靶点,初步揭示了沙参麦冬汤治疗肺癌的可能作用机制,为药物研发等提供参考。但本研究仅局限于数据库信息挖掘,其结论有待进一步实验研究或临床试验加以佐证。
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